Golang和biogo HTS包的安装

go的下载网址为https://studygolang.com/dl/

 wget https://studygolang.com/dl/golang/go1.11.linux-amd64.tar.gz
 tar -zxvf go1.11.linux-amd64.tar.gz

设置了一下shell的命令行显示情况（也可以不设置）
PS1='\w$ '

vi ~/.bashrc （添加以下内容）

export GOROOT=/usr/local/go

export PATH=$GOROOT/bin/:$PATH   

source ~/.bashrc

切换到root

mkdir /usr/local/go

chown -R user /usr/local/go

cp -r /home/user/go/* /usr/local/go

## 一定要把/home/user 下的go 这个文件夹删除，不然安装hts时会提示GOROOT， GOPATH之类的错误。

## 然后安装hts包（hts和 biogo是两个包，都需安装）

go get github.com/biogo/hts/...

go get github.com/biogo/biogo/...

使用biogo 读取bam文件可以参考这里

https://github.com/kussell-lab/mcorr/blob/master/cmd/mcorr-bam/read_bam.go