2019新型冠状病毒计算机辅助大规模药物筛选结果(Mpro蛋白)
【摘要】 由华中科技大学同济医学院基础医学院、华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院、西安交通大学第一附属医院、中科院北京基因组研究所、华为云组成的联合科研团队,针对2019新型冠状病毒的多个靶标蛋白,对8506种上市或者正在进行临床试验的药物中进行超大规模计算机辅助药物筛选工作,并在一周内取得了第一阶段成果。
2019新型冠状病毒计算机辅助大规模药物筛选结果(Mpro蛋白)
方法
我们构建了3个大规模药物筛选库:第一个药物筛选库使用DrugBank,包含了8506个药物分子;第二个药物筛选库使用ZINC数据库的224万先导化合物类似分子;第三个药物筛选库使用UniChem的1.6亿个药物分子。
我们使用的2019-nCoV Mpro蛋白的晶体结构由中科院饶子和院士团队提供,其他的病毒靶标蛋白由蛋白质同源建模和分子动力学模拟得到。
借助华为云AI昇腾集群云服务和医疗智能体药物研发平台,我们用一天时间完成了Mpro靶标蛋白对三个筛选库的大规模虚拟筛选,结果如下。
后续对其他靶标蛋白的筛选结果也会陆续公布。
Mpro靶标蛋白药物筛选结果
基于DrugBank的药物筛选排名1-10
基于ZINC的药物筛选排名1-10
基于UniChem的药物筛选排名1-10
医疗智能体官网:https://www.huaweicloud.cn/product/eihealth.html
相关新闻链接:https://www.huaweicloud.cn/news/2020/20200204113312294.html
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